Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Srp54bE9PXC0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms