Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Rsf1E9PWW9 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rsf1E9PWW9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Rsf1E9PWW9 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms