Protein–RNA interactions for Protein: E9PWS4

AU018091, Expressed sequence AU018091, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU018091E9PWS4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
AU018091E9PWS4 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
AU018091E9PWS4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms