Protein–RNA interactions for Protein: E9PW72

Gm3002, Predicted gene 3002, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3002E9PW72 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm3002E9PW72 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms