Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc144bE9PVZ3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccdc144bE9PVZ3 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms