Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Clca3bE9PUL3 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Clca3bE9PUL3 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms