Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Soga1E1U8D0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Soga1E1U8D0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms