Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Cngb1E1AZ71 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Cngb1E1AZ71 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms