Protein–RNA interactions for Protein: E0CZ16

Klhl3, Kelch-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl3E0CZ16 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Klhl3E0CZ16 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klhl3E0CZ16 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms