Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4U6

Gm5934, Predicted gene 5934, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5934D3Z4U6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5934D3Z4U6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Gm5934D3Z4U6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms