Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

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Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Nkx6-2D3Z4R4 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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