Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gm3543D3Z235 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Gm3543D3Z235 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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