Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ccdc6D3YZP9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ccdc6D3YZP9 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms