Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm6685D3YYP3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
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Gm6685D3YYP3 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Gm6685D3YYP3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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