Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Samd1D3YXK1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms