Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rexo5D3YW29 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rexo5D3YW29 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms