Protein–RNA interactions for Protein: D3YUH6

Ube2d4, Ubiquitin-conjugating enzyme E2D 4, mousemouse

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2d4D3YUH6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Ube2d4D3YUH6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
Ube2d4D3YUH6 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms