Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Catsperg2C6KI89 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Catsperg2C6KI89 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms