Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ptprz1B9EKR1 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ptprz1B9EKR1 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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