Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nxpe3B9EKK6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nxpe3B9EKK6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms