Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmf1B9EKI3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmf1B9EKI3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.7 ms