Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Phf11cB4XVP9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Phf11cB4XVP9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms