Protein–RNA interactions for Protein: B2RXZ1

Pnldc1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnldc1B2RXZ1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pnldc1B2RXZ1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pnldc1B2RXZ1 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms