Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cspp1B2RX88 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Cspp1B2RX88 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms