Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
1700018F24RikB2RW27 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
1700018F24RikB2RW27 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms