Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Clrn2B2RVW2 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms