Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC33.01■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Abcc8B2RUS7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Abcc8B2RUS7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms