Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Otud4B2RRE7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms