Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Uhrf1bp1B2KF50 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Uhrf1bp1B2KF50 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms