Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Brpf3B2KF05 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Brpf3B2KF05 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms