Protein–RNA interactions for Protein: B1AZ99

Otud3, OTU domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud3B1AZ99 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Otud3B1AZ99 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Otud3B1AZ99 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms