Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nipsnap3aB1AWZ3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms