Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnfrsf25B1AWN9 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tnfrsf25B1AWN9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms