Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ssxa1B1AUS7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ssxa1B1AUS7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
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