Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Grik3B1AS29 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Grik3B1AS29 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms