Protein–RNA interactions for Protein: B1ARD8

Slfn8, Schlafen 8, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn8B1ARD8 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Slfn8B1ARD8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Slfn8B1ARD8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms