Protein–RNA interactions for Protein: B0V2N1

Ptprs, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, mousemouse

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprsB0V2N1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PtprsB0V2N1 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PtprsB0V2N1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms