Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
4930435E12RikA6X8Z9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930435E12RikA6X8Z9 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms