Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CatsperbA2RTF1 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms