Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
H2al1jA2BFR3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
H2al1jA2BFR3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms