Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Tubb1A2AQ07 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tubb1A2AQ07 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms