Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Frmpd4A2AFR3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms