Protein–RNA interactions for Protein: A2ACP1

Ttc39a, Tetratricopeptide repeat protein 39A, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39aA2ACP1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc39aA2ACP1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ttc39aA2ACP1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms