Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rbbp8nlA2ABX0 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rbbp8nlA2ABX0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.3 ms