Protein–RNA interactions for Protein: A2ABU4

Myom3, Myomesin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myom3A2ABU4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Myom3A2ABU4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Myom3A2ABU4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms