Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtprfA2A8L5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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