Protein–RNA interactions for Protein: A2A7Q9

Rnf19b, E3 ubiquitin-protein ligase RNF19B, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf19bA2A7Q9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf19bA2A7Q9 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf19bA2A7Q9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf19bA2A7Q9 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf19bA2A7Q9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rnf19bA2A7Q9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Rnf19bA2A7Q9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms