Protein–RNA interactions for Protein: A2A6C4

Sppl2c, Signal peptide peptidase-like 2C, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2cA2A6C4 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sppl2cA2A6C4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms