Protein–RNA interactions for Protein: A2A4P4

Gm27029, Predicted gene, 27029, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27029A2A4P4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gm27029A2A4P4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gm27029A2A4P4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms