Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Trav12-2A0N8N6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
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Trav12-2A0N8N6 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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Trav12-2A0N8N6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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Trav12-2A0N8N6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Trav12-2A0N8N6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
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